Caractéristiques des malades atteints de COVID-19 hospitalisés en réanimation/soins intensifs : Comparaison des infections par variant delta et omicron. Une étude où plusieurs membres de l’IMRB ont participé et publiée dans Nature Communications du 12 octobre 2022.

Cinétique des variants SARS-CoV-2 identifiés chez les patients admis en réanimation pour formes graves de COVID-19 pendant la période de l’étude.

L’infection par le variant Omicron du SARS-CoV-2 et ses sous-linéages est considérée comme moins grave que l’infection par les variants pré-existants, en particulier le variant Delta. A ce jour, peu de données sont disponibles sur les caractéristiques cliniques et virologiques moléculaires associées à la gravité de l’infection Omicron chez les patients hospitalisés en réanimation.

Les équipes de Médecine Intensive-Réanimation (service du Pr Armand MEKONTSO DESSAP) et de Virologie (service du Pr Jean-Michel PAWLOTSKY) soutenues par l’Unité de Recherche Clinique (Pr Etienne AUDUREAU) des Hôpitaux Universitaires Henri Mondor, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris, ont conduit une étude de cohorte prospective observationnelle multicentrique visant à décrire les caractéristiques cliniques et virologiques des patients pris en charge dans 22 services de réanimation en France pour une infection sévère à SARS-CoV-2 entre décembre 2021 et mai 2022.

Analyse non supervisée des caractéristiques cliniques et biologiques des patients infectés par les variants Delta et Omicron par self-organized maps.

Les résultats de l’étude SEVARVIR* (Investigateur principal : Pr Slim FOURATI ; Responsable scientifique : Pr Nicolas DE PROST), publiée dans Nature Communications, montrent que le phénotype clinique des patientinfectés par Omicron diffère de celui des patients infectés par Delta (43% des patients infectés par Omicron étaient immunodéprimés contre 13% des patients Delta). Le taux de mortalité des patients immunodéprimés infectés par le variant Omicron était significativement plus élevé que celui des patients immunocompétents. A l’admission en réanimation, le titre d’anticorps circulants anti-SARS-CoV-2 était significativement inférieur chez les patients immunodéprimés vaccinés en comparaison aux patients immunocompétents vaccinés. Aucune association entre des profils mutationnels virologiques spécifiques et la mortalité n’a été observée.

*Etude financée par le Ministère de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l’Innovation dans le cadre du consortium EMERGEN, coordonné par Santé publique France et l’ANRS/Maladies Infectieuses Émergentes, qui assure la surveillance de l’évolution génétique du virus SARS-CoV-2 à l’échelle nationale.

Accès à l’article :

Clinical phenotypes and outcomes associated with SARS-CoV-2 variant Omicron in critically ill French patients with COVID-19, Nature Communications du 12 octobre 2022.