Imagerie

La plateforme apporte son expertise aux personnels de l’IMRB et aux utilisateurs extérieurs pour l’histologie et la microscopie. La plateforme d’imagerie est certifiée ISO 9001 depuis avril 2014. Cette certification garantie le suivi de règles de management de la qualité. La plateforme fournit le matériel depuis la préparation des échantillons jusqu’à l’observation en microscopie.
La plateforme se compose en 2 plateaux :

 

1) Plateau d’Histologie

2) Plateau de Microscopie Optique

 

 

1) Plateau d’Histologie

La plateforme met en œuvre un ensemble d’équipements permettant :

a) la préparation pour la microscopie optique

b) la préparation pour la microscopie électronique

 

a) Préparation pour la miscroscopie optique

La plateforme fournit un service allant de la préparation de l’échantillon à la coupe et des équipements pour la coupe en paraffine ou en congélation et pour l’immunohistochimie.

 

  • Réalisation de blocs de paraffine à partir d’échantillons fixés
    Les tissus doivent être fixés. La taille de l’échantillon ne doit pas excéder 4mm d’épaisseur sur 2cm de largeur et 2,5cm de longueur.
    La chaîne de préparation commence par la déshydratation et l’imprégnation en paraffine des échantillons. Ces étapes sont réalisées par un automate Milestone Logos afin d’obtenir une imprégnation optimale des échantillons. Une fois les échantillons imprégnés en paraffine, ils sont inclus en un bloc de paraffine grâce à une station d’enrobage Leica Arcadia.
  • La réalisation de coupes
    Les coupes sont obtenues avec un microtome semi-automatique Thermo Scientific HM 340E ou un microtome automatique Leica Histocore Multicut à partir de blocs en paraffine. Les coupes peuvent avoir une épaisseur de 3 à 30µm. Les coupes sont réalisées sur des lames soit Super-Frost + (pour l’immuno-histochimie), soit des lames sans traitement (pour une coloration histologique ultérieure).
De gauche à droite : automate d’imprégnation Logos, fontaine à paraffine Arcadia, microtome Histocore
  • Coloration

La coloration se fait avec un automate ThermoScientific Gemini AS.

Colorations proposées :

Hémalun de Mayer/ésosine : les noyaux sont visibles en violet et le cytoplasme en rose

Rouge Sirius : le cytoplasme est jaune, les fibres de collagènes apparaissent en rouge

Coupe de foie colorée en Hemalun/Eosine
Coupe de poumon colorée en Rouge Sirius
  • Immunohistochimie

Le personnel du plateau histologie peut assister pour la mise au point de protocoles d’immunohistochimie.

Un automate d’Immunohistochimie Epredia Autostainer 360 et son PT Module sont utilisables pour automatiser les immuno-histo-chimie. Ces matériels sont utilisables après formation par les personnels du plateau d’histologie.

Automate d'immuno-histo-chimie Autostainer 360
  • Formation interne

Le personnel de la plateforme met à disposition un cryo-microtome Leica CM3050S et un microtome Shandon Finesse 325. Le cryo-microtome Leica CM3050S permet des coupes à congélation jusqu’à -40 °C pour une épaisseur de 5 à 100 µm. Le microtome permet des coupes en paraffine de 3 à 30 µm. Le microtome est accompagné d’une plaque froide Histostar afin de refroidir et durcir les blocs et d’une plaque chauffante afin de lisser les coupes.

Ces équipements sont accessibles après formation par le personnel de la plateforme et la réservation se fait sur : https://imrb.inserm.fr/espace-reservation/

b) Préparation pour la microscopie électronique

La plateforme réalise aussi l’ensemble des opérations pour l’obtention de grilles en microscopie électronique en transmission.

 

  • Préparation des blocs de résine EPON
    La fixation étant faite au glutaraldéhyde, le volume des tissus doit impérativement être de 1mmx1mmx1mm. Avant l’imprégnation en résine EPON, les échantillons sont soumis à une deuxième fixation au tetraoxyde d’osmium.
  • Réalisation de coupes semi-fines
    Des coupes de 2µm sont faites puis colorées avec un mélange Azure II/bleu de méthylène. Elles permettent de sélectionner la zone d’intérêt afin de réaliser les coupes Ultra-fines.
  • Préparation de grilles pour la microscopie électronique en transmission
    3 à 4 coupes de 60 à 150nm d’épaisseur sont déposées sur des grilles de cuivre. Après avoir été contrastées à l’acétate d’uranyle/citrate de plomb, les grilles sont prêtes pour l’observation.

2) Plateau de Microscopie Optique

Le plateau de microscopie optique est dédié à l’acquisition en microscopie de préparations histologiques ou fluorescentes. Ils sont utilisables uniquement après formations par la plateforme et la réservation se fait sur : https://imrb.inserm.fr/espace-reservation/

Plusieurs microscopes sont disponibles :

  • a) Microscope Axioplan 2
  • b) Microscope AxioImager M2
  • c) Microscope confocal LSM 900
  • d) Microscope inversé AxioVert A1
  • e) Scanner de lames Axioscan 7
  • f) Incucyte

a) Microscope Axioplan 2 :

Ce microscope est dédié à l’acquisition en “lumière blanche” pour l’histologie. Il est équipé d’une caméra Zeiss MRc pour l’obtention d’image couleur et d’une série d’objectif (Plan-NeoFluar x5/0,16 ; Acroplan x10/0,25 ; x20/0,45. Plan-Neofluar x40/0,75 ; x63/1,25 huile) pour un large choix de grandissement. Les acquisitions se font avec le logiciel Zeiss Zen 2012.

b) Microscope AxioImager M2 :

L’AxioImager M2 est dédié à la microscopie en fluorescence. Il est doté de 4 cubes pour la fluorescence (DAPI, A488/FITC, A547/TRITC, To-Pro3/Cy5) couvrant les molécules fluorescentes les plus utilisées en recherche biologique. Les images sont obtenues par la caméra monochrome Zeiss MRm. Les objectifs sont : Acroplan x10/0,25 ; x20/0,45 ; Plan-Neofluar x40/0,75. Le logiciel Zen 2012 pilote le microscope et la caméra.

c) Microscope confocal LSM 900 Airyscan 2 :

Le confocal est installé sur un microscope inversé Zeiss Axio Observer 7. Il est équipé d’une platine motorisée et d’une chambre thermostatée. Les diodes LASER (405 nm, 488 nm, 561 nm, 638 nm) permettent de couvrir un large éventail de molécules fluorescentes utilisées en biologie. Ce système permet l’étude de distribution de marqueurs fluorescents, de colocalisation, l’analyse spectrale (séparation des spectres de fluorescence) et des applications en cellules vivantes (vidéo-microscopie, FRAP) ainsi qu’une approche pour la super-résolution.

d) Microscope inversé AxioVert A1 :

Le microscope inversé est dédié à l’aquisition en phase et en couleur de cellules sur plusieurs types de support. Il est équipé d’une caméra Zeiss Axiocam 105 couleur et d’une série d’objectif à longue distance de travail (LD A-Plan 5x/0.15 Ph1, LD A-Plan 10x/0.25 Ph1, LD A-Plan 20x/0.35 Ph1, LD A-Plan 40x/0.55 Ph1). Les acquisitions se font avec le logiciel Zeiss Zen 2012.

e) Scanner de lames Axioscan 7 :

Le scanner de lames permet de numériser aussi bien les coupes en lumière blanche, en lumière polarisée ou en fluorescence. Il est équipé d’objectifs Plan-Apochromat 10x/0,4, 20x/0.8 et 40x/0,95 et des cubes pour la fluorescence permettant de couvrir un large spectre de molécules fluorescentes ainsi qu’un polariseur circulaire et un analyseur pour la lumière polarisée.

f) Incucyte S3 :

Il s’agit d’un système d’imagerie automatisé installé dans un incubateur pour faire des enregistrements de cellules vivantes ou d’organoïdes sur de long temps. Il accepte divers types de supports allant de la flasque à la boite multi-puits.
Il est équipé pour la fluorescence et le contraste de phase.

Les documents, à destination des agents, mis à disposition par la plateforme d’imagerie se trouvent dans la bibliothèque de données de la page de la plateforme.

 

CONTACT : Nous contacter

 


La norme ISO 9001 définit une série d’exigences concernant la mise en place d’un système de management de la qualité dans un organisme, quels que soient sa taille et son secteur d’activité.

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