La plateforme de bio-informatique de l’Institut Mondor de Recherche Biomédicale est créée en 2017 pour offrir aux équipes de recherche de l’IMRB, et plus généralement à l’UPEC (Université Paris-Est Créteil) et aux extérieurs :
- Un accès à des moyens de calculs
Création d’un compte et d’un espace de travail
Accès aux moyens de calcul via un schéduleur (slurm)
Accès aux logiciels et banques installées
Possibilité d’installer, de déployer en local des pipelines et des banques dédiées.
- Un accompagnement avec réalisations d’analyses bio-informatiques
Conseil en amont des analyses bio-informatiques et/ou bio statistiques
Prise en charge de l’analyse bio-informatique et rendu des résultats
Formation et/ou aide
- Une expertise bio-informatique
- Exemple de pipelines/prestations
– Recherche de variants
– Métagénomique 16S
– Chip-seq
– RNA-seq
– scRNA-seq
– Modélisation de systèmes biologiques
- Equipements :
– 1 serveur de calcul composé de 7 nœuds 16C (32Go de RAM par nœud + GPU) et 7 nœuds 16C (512Go RAM par nœud)
– Stockage local (100 To)
– Baie disque NAS 85 To (avec réplication)
